Главни правци лечења миокардитиса лековима одређени су главним карикама патогенезе миокардитиса: упалом изазваном инфекцијом, неадекватан имуни одговор, смрт кардиомиоцита (због некрозе и прогресивне дистрофије, миокардитична кардиосклероза) и поремећај метаболизма кардиомиоцита. Треба узети у обзир да се код деце миокардитис често јавља на позадини хроничне фокалне инфекције, која постаје неповољна позадина (интоксикација и сензибилизација организма), доприносећи развоју и прогресији миокардитиса.