Аномалије структуре бубрежног паренхима деле се на мегакаликс, Фанконијеву болест и сунђераст бубрег. Ови развојни дефекти су често праћени оштећеном функцијом бубрега.
Фузија бубрега је развојни дефект који се манифестује срастањем два бубрега у један орган. Ова аномалија се јавља са учесталошћу од 3,5% случајева међу свим дефектима бубрега.
Ренална дистопија је развојна аномалија коју карактерише абнормални положај бубрежних структура. Овај развојни дефект јавља се са учесталошћу од 2,8% свих развојних дефеката бубрега.
Ренална хипоплазија је развојна аномалија коју карактерише смањење величине бубрега. Овај дефект се јавља са учесталошћу од 0,9% међу свим аномалијама бубрега.
Дуплирање бубрега је најчешћа малформација бубрега, која чини 10,4% свих аномалија уринарног тракта. Према патолошким налазима, дуплирање бубрега се јавља са учесталошћу 1:150.
Агенеза, или бубрежна аплазија - конгенитални један бубрег, потпуно одсуство бубрега и бубрежних крвних судова чини 1% свих дефеката. Учесталост аномалије, према подацима обдукције, је 1 на 1100.
Реналне васкуларне аномалије се деле на конгениталне дефекте структуре, количине, облика и положаја артеријских крвних судова и најчешће се дијагностикују међу свим аномалијама бубрега и уринарног тракта.
Хилурија је патолошко стање које је праћено ослобађањем лимфе са урином. Урин је млечне боје. Хилурија настаје као резултат фистуле између лимфног система и уринарног тракта.