У болници, лечење некомпликованих чирева желуца траје 20-30 дана, а за чиреве дванаестопалачног црева - 10 дана. Приликом отпуста из болнице, пацијенту се даје правно обавезујући документ (извод из медицинске историје), који указује на потпуну дијагнозу болести и индивидуалне карактеристике болести (локализација и величина чира, компликације пептичког улкуса, претходне операције због пептичког улкуса, препоруке за лечење), а такође бележи и пратеће болести чира.