H. influenzae су грам-негативне плеоморфне ћелије штапићастог или кокоидног облика димензија (0,2-0,3) x (0,5-2) µm. Налазе се у размазима појединачно или у паровима, а понекад и у облику кратких ланаца и група. На густим медијумима формирају мале (до 1 mm у пречнику) округле безбојне колоније. Микроорганизми су непокретни, не формирају споре, али је могуће формирање капсуларних облика, са којима су повезана патогена својства. Патоген производи ендотоксин, чији се носилац сматра капсуларним полисахаридима.