Студија: гени утичу на ефикасност воћа и влакана против рака

Недавна студија објављена у часопису eBioMedicine идентификовала је генетске варијације које могу изменити везу између уноса влакана, воћа и поврћа и ризика од колоректалног карцинома (КРК). Истраживачи су успешно идентификовали два значајна локуса која мењају везу између уноса влакана и воћа и ризика од КРК.

Карцином колоректалног карцинома (КРК) је један од најчешћих карцинома на свету, са скоро два милиона нових случајева и преко 900.000 смртних случајева у 2020. години. Пријављено је да висок унос воћа, поврћа, интегралних житарица и дијететских влакана смањује ризик од КРК. Иако постоје јаки докази о повезаности између ризика од КРК и уноса интегралних житарица и дијететских влакана, докази о повезаности између ризика од КРК и уноса воћа и поврћа остају ограничени.

Претходне студије асоцијације на нивоу целог генома (GWAS) идентификовале су најмање 200 локуса повезаних са ризиком од колоректалног карцинома, објашњавајући до 35% херитабилности. Иако интеракције гена и окружења (G × E) могу објаснити додатну херитабилност, претходне студије са малим узорцима и традиционалним методама пронашле су само ограничен број значајних интеракција. Нови статистички приступи, као што су конјонтни тестови и двостепене методе које дају приоритет полиморфизмима једног нуклеотида (SNP), имају потенцијал да побољшају тачност ових анализа.

У анализу је укључено до 45 студија из три генетска конзорцијума за колоректални рак, укључујући појединце европског порекла. Студије су обухватале скупове случај-контрола за кохортне студије и контроле без рака за студије случај-контрола. Укупно 69.599, 69.734 и 44.890 учесника је анализирано на унос воћа, поврћа и влакана, респективно. Унос хране је процењен коришћењем упитника о учесталости конзумирања хране и историје исхране, обично изражених као порције дневно за воће и поврће и грамима дневно за укупна влакна.

Подаци су усклађени и изражени као квартилне вредности по полу и студији. Поред тога, контрола квалитета генотипизације обухватала је проверу недостајућих података, Харди-Вајнбергове равнотеже и неусклађености полова, након чега је уследила импутација и филтрирање за учесталост и тачност мањих алела, што је резултирало анализом 7.250.911 SNP-ова.

У поређењу са контролном групом, учесници са колоректалним карциномом били су старији, имали су виши индекс телесне масе и унос енергије, као и већу преваленцију фактора ризика као што су породична историја колоректалног карцинома и дијабетеса типа 2. Такође су конзумирали мање влакана, воћа и поврћа у поређењу са контролном групом. Мета-анализе су пронашле инверзну везу између уноса влакана (релативни ризик по квартилном повећању (OR) = 0,79), воћа (OR = 0,79) и поврћа (OR = 0,82) и ризика од колоректалног карцинома.

3-DF тест је идентификовао локус rs4730274 узводно од гена SLC26A3, што показује повезаност са уносом влакана и интеракцију са ризиком од колоректалног карцинома. Стратификација по генотипу показала је јачу инверзну повезаност између влакана и колоректалног карцинома за сваку копију алела Т. Функционална анотација је сугерисала активност појачивача у ткивима дебелог црева, са eQTL за ген DLD.

Локус rs1620977 близу гена NEGR1 показао је значајну повезаност са конзумирањем воћа и умерену интеракцију са ризиком од колоректалног карцинома. Јаке инверзне повезаности су примећене са повећањем конзумирања воћа за сваку копију G алела.

Студија је до сада највећа G×E студија, у којој су истраживачи идентификовали две интеракције између влакана, уноса воћа и ризика од колоректалног карцинома. Конкретно, rs4730274 близу гена SLC26A3 указује на значајну везу између уноса влакана, функције црева, упале и колоректалног карцинома. Резултати захтевају даља истраживања како би се испитале клиничке импликације и потврдили ови налази у различитим популацијама.