Научници идентификују потенцијалну мету за будућу вакцину против ХИВ-а

Вирус хумане имунодефицијенције је успевао да измиче произвођачима вакцина већ 30 година, делом због своје невероватне способности мутације, што му омогућава да лако заобиђе све унапред успостављене препреке.

Али сада, изгледа да су научници са Масачусетског технолошког института и Института Ригон (оба у САД) успели да пронађу обећавајућу стратегију за дизајн будуће вакцине која користи математички приступ који је успешно тестиран за решавање проблема у квантној физици, као и у анализи флуктуација цена на берзи.

Вакцине уче имуни систем да одмах реагује на специфичне молекуларне карактеристике патогена. Али способност вируса хумане имунодефицијенције (ХИВ) да мутира чини практично немогућим избор праве вакцине. У потрази за новом стратегијом, научници су одлучили да одустану од циљања појединачних аминокиселина. Уместо тога, кренули су у идентификацију независно еволуирајућих група аминокиселина у протеинима, где се унутар сваке групе аминокиселине развијају у тандему, односно „гледају једна другу“ како би одржале одрживост вируса. Истраживачи су били посебно упорни у потрази за таквим групама, еволуције унутар којих би имале највеће шансе да се заврше колапсом ХИВ-а – његовом даљом неодрживошћу. Затим, спровођењем вишестраног напада на управо таква места у вирусу, било би могуће да га заробе „између две ватре“: или би га имуни систем задавио, или би мутирао и самоуништио се.

Користећи теорију случајних матрица, тим је тражио еволутивна ограничења у такозваном Gag протеинском сегменту ХИВ-а, који формира протеинску љуску вируса. Потребно је било да пронађу колективно еволуирајуће групе аминокиселина са високим нивоом негативних корелација (и малим бројем позитивних, што омогућава вирусу да преживи), када вишеструке мутације уништавају вирус. И такве комбинације су пронађене у региону који су сами истраживачи назвали Gag сектор 3. Он је укључен у стабилизацију протеинске љуске вируса, тако да су вишеструке мутације на овом месту преплављене колапсом структуре вируса.

Занимљиво је да су истраживачи, када су испитали случајеве ХИВ-ом заражених људи који су природно били у стању да се боре против вируса, открили да имуни систем ових пацијената преференцијално напада Gag сегмент 3.

Аутори сада покушавају да пронађу друге сличне регионе у структури вируса изван Gag сектора, а такође развијају елементе активних компоненти будуће вакцине која ће научити имуни систем да тренутно реагује на присуство протеина Gag сектора 3 и одмах га нападне на прави начин.

Тестирање на животињама је следеће, али за сада ће сви детаљи рада бити представљени на 56. годишњој конференцији Биофизичког друштва, која ће се одржати од 25. до 29. фебруара у Сан Дијегу, Калифорнија, САД. Резиме презентације доступан је на овом линку.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ], [ 5 ], [ 6 ], [ 7 ], [ 8 ]